在制定员工安全手册时，是否应该针对不同部门或岗位有所区分取决于具体情况。一般来说，可以考虑以下几个因素：
工作性质的差异：不同部门或岗位的工作性质可能存在较大差异，需要面临不同的安全风险和挑战。因此，可以根据工作性质的不同，对安全手册进行区分，确保员工能够接受到与其工作相关的安全培训和指导。
法律法规的要求：某些行业或岗位可能有特殊的法律法规要求，需要针对性地对员工进行安全培训和指导。因此，在制定员工安全手册时，需要遵循相关法律法规的要求，确保员工的安全行为符合法律规定。
公司的安全文化：公司的安全文化对员工安全意识的培养和促进起着重要作用。根据公司的安全文化特点，可以对员工安全手册进行定制化，使其更符合公司的安全理念和价值观。
风险评估结果：在制定员工安全手册时，可以进行风险评估，了解不同部门或岗位存在的安全风险情况。根据风险评估的结果，可以有针对性地对员工安全手册进行区分，加强对高风险部门或岗位的安全管理措施。
综上所述，针对不同部门或岗位有所区分的员工安全手册制定，可以根据工作性质、法律法规、公司安全文化和风险评估等因素进行考量，以提高员工安全意识和减少安全事故发生的可能性。