在通知员工被进行程序性免职时，公司应当遵循以下步骤：
提前准备：在决定进行程序性免职之前，公司应当进行充分的调查和评估，确保有充分的证据支持免职决定。
选择适当时间和地点：通知员工被免职应当选择适当的时间和地点，避免在公共场合或其他可能引起尴尬的地方通知。
直接而坦诚：通知员工时，应当直接而坦诚地说明免职的原因，避免模糊或含糊其辞，同时要避免过分冷漠或伤害员工情感。
提供支持和资源：在通知员工被免职时，公司应当提供必要的支持和资源，例如解释福利待遇、提供离职手续指导等。
保护隐私：在通知员工被免职时，公司应当尊重员工的隐私权，避免在其他员工面前公开员工个人信息。
跟进和反馈：公司应当在免职后进行跟进，确保员工的离职手续顺利进行，并及时提供必要的反馈和指导。
总之，通知员工被进行程序性免职是一件敏感而重要的事情，公司应当在处理过程中保持专业、坦诚和尊重，以确保员工的权益和公司形象不受损害。