怀孕期间协议离婚的程序：
1、协议离婚必须亲自向一方户口所在地的婚姻登记管理机关申请，不得委托别人代理；
2、婚姻登记管理机关受理离婚登记申请后，应当在一个月内进行审查；
3、经婚姻登记管理机关审查，符合离婚条件的，应当登记，发给离婚证，注销结婚证。因为女人怀孕了，所以男人不能提起离婚诉讼，只能作为原告提起离婚诉讼，分割财产和债务。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国民法典》
第一千零七十 婚姻登记机关查明双方确实是自愿离婚，并已经对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的，予以登记，发给离婚证。